Alfonso Valencia

2012

• Evidence for transcript networks composed of chimeric RNAs in human cells.

  PloS one

  S. Djebali, J. Lagarde, P. Kapranov, V. Lacroix, C. Borel, J. M. Mudge, C. Howald, S. Foissac, C. Ucla, J. Chrast, P. Ribeca, D. Martin, R. R. Murray, X. Yang, L. Ghamsari, C. Lin, I. Bell, E. Dumais, J. Drenkow, M. L. Tress, J L. Gelpí, M. Orozco, A. Valencia, N. L. van Berkum, B. R. Lajoie, M. Vidal, J. Stamatoyannopoulos, P. Batut, A. Dobin, J. Harrow, T. Hubbard, J. Dekker, A. Frankish, K. Salehi-Ashtiani, A. Reymond, S. E. Antonarakis, R. Guigó, and T. R. Gingeras
• BLUEPRINT to decode the epigenetic signature written in blood.

  Nature biotechnology

  D. Adams, L. Altucci, S. E. Antonarakis, J. Ballesteros, S. Beck, A. Bird, C. Bock, B. Boehm, E. Campo, A. Caricasole, F. Dahl, E. T. Dermitzakis, T. Enver, M. Esteller, X. Estivill, A. Ferguson-Smith, J. Fitzgibbon, P. Flicek, C. Giehl, T. Graf, F. Grosveld, R. Guigó, I. Gut, K. Helin, J. Jarvius, R. Küppers, H. Lehrach, T. Lengauer, A. Lernmark, D. Leslie, M. Loeffler, E. Macintyre, A. Mai, J H. Martens, S. Minucci, W. H. Ouwehand, P G. Pelicci, H. Pendeville, B. Porse, V. Rakyan, W. Reik, M. Schrappe, D. Schübeler, M. Seifert, R. Siebert, D. Simmons, N. Soranzo, S. Spicuglia, M. Stratton, H. G. Stunnenberg, A. Tanay, D. Torrents, A. Valencia, E. Vellenga, M. Vingron, J. Walter, and S. Willcocks

2011

• Whole-genome sequencing identifies recurrent mutations in chronic lymphocytic leukaemia.

  Nature

  X. S. Puente, M. Pinyol, V. Quesada, L. Conde, G. R. Ordóñez, N. Villamor, G. Escaramis, P. Jares, S. Beà, M. González-Díaz, L. Bassaganyas, T. Baumann, M. Juan, M. López-Guerra, D. Colomer, J. M. C. Tubío, C. López, A. Navarro, C. Tornador, M. Aymerich, M. Rozman, J. M. Hernández, D. A. Puente, J. M. P. Freije, G. Velasco, A. Gutiérrez-Fernández, D. Costa, A. Carrió, S. Guijarro, A. Enjuanes, L. Hernández, J. Yagüe, P. Nicolás, C. M. Romeo-Casabona, H. Himmelbauer, E. Castillo, J. C. Dohm, S. de Sanjosé, M. A. Piris, E. de Alava, J. San Miguel, R. Royo, J L. Gelpí, D. Torrents, M. Orozco, D. G. Pisano, A. Valencia, R. Guigó, M. Bayés, S. Heath, M. Gut, P. Klatt, J. Marshall, K. Raine, L. A. Stebbings, A. P. Futreal, M. R. Stratton, P. J. Campbell, I. Gut, A. López-Guillermo, X. Estivill, E. Montserrat, C. López-Otín, and E. Campo
• Exome sequencing identifies recurrent mutations of the splicing factor SF3B1 gene in chronic lymphocytic leukemia.

  Nature genetics

  V. Quesada, L. Conde, N. Villamor, G. R. Ordóñez, P. Jares, L. Bassaganyas, A. J. Ramsay, S. Beà, M. Pinyol, A. Martínez-Trillos, M. López-Guerra, D. Colomer, A. Navarro, T. Baumann, M. Aymerich, M. Rozman, J. Delgado, E. Giné, J. M. Hernández, M. González-Díaz, D. A. Puente, G. Velasco, J. M. P. Freije, J. M. C. Tubío, R. Royo, J L. Gelpí, M. Orozco, D. G. Pisano, J. Zamora, M. Vázquez, A. Valencia, H. Himmelbauer, M. Bayés, S. Heath, M. Gut, I. Gut, X. Estivill, A. López-Guillermo, X. S. Puente, E. Campo, and C. López-Otín